تعتبر كلية العلوم بالجامعة الإسلامية من الكليات الحديثة التي تمت الموافقة السامية على إنشائها في 28/5/1431هـ والتي بدأت مسيرتها عام 1433/1434 هـ، وهي أحد المنابع الرئيسية لتزويد المجتمع بمختصين على مستوى عالي في أفرع العلوم المختلفة عن طريق تقديم برامج متميزة تكون محفزة للإبداع والارتقاء بالبحث العلمي بما يخدم العملية التعليمية والبحثية وخدمة المجتمع
وتشمل الكلية الأقسام العلمية التالية: قسم الرياضيات، قسم الفيزياء، قسم الكيمياء، وتمنح الكلية درجة البكالوريوس في العلوم في تخصصات الرياضيات، الفيزياء، والكيمياء للطلاب، كما تمنح الكلية درجة الماجستير المهني في المختبرات الصناعية والماجستير في تخصص: العلوم في الرياضيات والفيزياء والكيمياء. ويوجد بالكلية عدد من المختبرات العلمية المجهزة بأحدث الأجهزة والأدوات المعملية لتحقيق جودة عالية من التعليم.
وتقوم الكلية بتنظيم دورات تدريبية، وندوات، ومحاضرات مهمه الهدف منها رفع مستوى المهارات العلمية والفنية لدى طلاب ومنسوبين الكلية والجامعة من جهة والمهتمين بالعلوم وتطبيقاتها من جهة أخرى.
وتسعى الكلية في بناء شراكات مُجتمعية مُتميزة، والاتجاه إلى الجودة وتحقيق الاعتماد الأكاديمي المؤسسي الكامل بعد حصول جميع برامجها على الاعتماد الأكاديمي المشروط من المركز الوطني للتقويم والاعتماد الأكاديمي التابع لهيئة تقويم التعليم والتدريب (NCAAA) وتطمح الكلية إلى تحقيق الريادة وفقاً لرسالتها ورؤيتها وأهدافها.